Diyanet İşleri Başkanlığı, Koç’un diplomasının sahte olduğundan şüphelenerek Milli Eğitim Bakanlığı’ndan gerçekliğini sorgulamayı talep etti. Açık Öğretim Bilgi Yönetim Sistemi üzerinden yapılan incelemede, Koç’un Açık Öğretim Lisesi’ne hiç kayıt yaptırmadığı, okul öğrencisi olmadığı, diplomasında yazan numaranın başka bir öğrenciye ait olduğu tespit edildi.
Bu tespit üzerine Milli Eğitim Bakanlığı ve Diyanet İşleri Başkanlığı, Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığı’na ihbarda bulundu. Bunun üzerine Hazine ve Maliye Bakanlığı da harekete geçerek Koç’un maaşını kesti.
Diyarbakır Ağır Ceza Mahkemesi’nde, “resmi belgede sahtecilik” ve “kamu kurumlarını dolandırmak” suçlarından dava açtı.
Koç’un yalnızca diploma sahteciliğiyle yetinmediği, belgenin fotokopisine Üsküdar 15. Noterliği’nde “aslı gibidir” işlemi yaptırarak Eskişehir Anadolu Üniversitesi Açık Öğretim Fakültesi’ne kayıt olduğu ortaya çıktı. Ardından sözleşmeli imam hatiplik alımında ortaöğretim mezunu gibi evrak sundu ve Diyarbakır Müftülüğü’ne bağlı Lice’nin Ortaç Köyü’nde imam olarak göreve başladı. Görevini sürdürürken Açık Öğretim Fakültesi İlahiyat Bölümü’nden mezun oldu.
Yavuz Koç, ifadesinde ''Ben dolandırıcı değilim, kendi isteğimle istifa ettim. Bu davanın neden kapanmadığını anlamıyorum. Suç tarihinde boşandığım eski eşimin şikayeti üzerine bu süreç başladı'' dedi.